Молекулярное кариотипирование (относительная гибридизация генома)

Молекулярное кариотипирование Молекулярно-цитогенетический анализ, позволяющий точно и быстро выявить те несбалансированные хромосомные аномалии, связанные с изменением числа копий ДНК (микроделеции и микродупликации), которые невозможно обнаружить с помощью классического хромосомного анализа.

Этот метод исследует весь геном с более высоким разрешением и может объяснить фенотип в 5-10 раз чаще, чем классический метод кариотипирования, что дает ему преимущество в ситуациях, когда невозможно исследование культуры клеток.

Тест основан на методе сравнительной геномной гибридизации (CGH) двух типов ДНК - ДНК пациента и контрольного образца ДНК. Это позволяет идентифицировать CNV (варианты номера копии), которые подразделяются на 5 категорий:

• Доброкачественные вариации;
• Вариации неизвестного значения (VOUS) (возможно доброкачественные);
• VOUS с неопределенным значением;
• Возможный патогенный ВОУС;
• Явно патогенный ВОУС;

Эти субмикроскопические распределения генома (варианты) широко распространены по всему геному и представляют собой важный фактор эволюции, фенотипической дифференциации и восприимчивости к определенным заболеваниям.

Молекулярное кариотипирование используется как для обследования, так и для диагностики.

Когда мы должны пройти тест?

Молекулярное кариотипирование является первым тестом в постнатальной диагностике.

• Пациенты с множественными врожденными дефектами/признаками дисморфии, не являющимися частью известного генетического синдрома;
• Младенцы с множественными врожденными дефектами, у которых кариотип неприемлем;
• Дети с задержкой психомоторного развития;
• Пациенты с ограниченными интеллектуальными возможностями;
• Пациенты с расстройствами аутистического спектра;
• Другие случаи, такие как задержка роста, задержка речи и т. д.

В чем преимущества молекулярного кариотипирования методом сравнительной геномной гибридизации?

• Повышенная клиническая полезность. Частота выявления патогенных ХНВ (вариантов копийности) у детей с задержкой развития, умственной отсталостью и множественными врожденными дефектами составляет 18-20%, при классическом кариотипировании - 3%.
• В среднем разрешение обнаружения высокое. Он предлагает перспективу с высоким разрешением по всему геному (в 10 раз выше, чем при классическом кариотипировании).
• Один тест эквивалентен тысячам экспериментов FISH/MLPA;
• Обнаруживает субмикроскопические дупликации, делеции, несбалансированные хромосомные перестройки и различные степени мозаицизма.
• Культура клеток для исследования не требуется.

Ограничения тестовой диагностики

• Не выявляет сбалансированных хромосомных изменений (смещений, инверсий, вставок), точечных мутаций, мозаицизма низкого уровня. Эти изменения обнаруживаются другими генетическими тестами;
• Не дает информации о структурной природе выявленных аномалий;
• Он может обнаруживать CNV неизвестного значения, которые требуют дальнейшего тестирования и анализа.

Какова роль генетика?

Исследование требует консультации с генетиком.

Роль генетика важна, потому что генетическое консультирование до и после тестирования помогает пациенту понять преимущества и ограничения метода, а также результат теста.

Фенотипические данные пациентов необходимы для интерпретации результатов, а тесное сотрудничество с врачом помогает ставить точные диагнозы и улучшать ведение пациентов.

Как подготовиться к исследованию?

Специальной подготовки к тесту не требуется.

Материал исследования

Венозная кровь

Возможная интерпретация результатов

Молекулярное кариотипирование описывает обнаруженные несбалансированные количественные и структурные изменения (утрата или прирост генетического материала), точки разрыва, точные измерения изменений.

Окончательную клиническую интерпретацию результата делает врач-генетик в зависимости от фенотипа пациента и генетического состава хромосомных участков, вовлеченных в изменения.

Тест может быть подтвержден, в зависимости от ситуации, классическими цитогенетическими или молекулярными методами, такими как FISH или qPCR/MLPA.

Ресурсы

https://www.synevo.ro/shop/cariotip-molecular-hibridizarea-genomica-comparativa/